许多科学家认为同性恋倾向并不是同性恋者自身的简单选择，相反它是由同性恋者本身的一些生物因素决定的。近年来，科学家、心理学家不断对关于同性恋的各种传统观念提出质疑。他们已经开始研究荷尔蒙对人在胎儿时期的影响与人的性取向的联系。

如果这种联系存在，那么我们有理由支持这种观说法：“同性恋者的性倾向是天生的，他本人无法改变，他也没有必要为自己的性倾向负责。”有一些人甚至认为不管个人所处的社会环境如何，他是同性恋还是异性恋是注定的。

越来越多的科学家开始为这种观点“同性恋倾向和人体内部雄性与雌性荷尔蒙的比例有关”而寻找证据。研究的结果也显示男同性恋者体内的雄性荷尔蒙明显少于同等条件下的异性恋男性。这项结果导致了另一个重要的问题“同性恋基因是否存在”？

1993年，Dean Hamer 对40对同性伴侣进行了一系列研究。他发现许多同性恋者的X染色体上都带有一段被叫做Xq28的基因片段。通过考察这些同性恋者的家族历史，结果显示这些家族中的男性有很大的成为同性恋者的可能性。

更进一步的研究巩固了同性恋基因存在这种理论，比如Ann Perkins博士的研究，他发现10%的公羊对其他公羊感兴趣，10%的公羊没有性倾向。这些研究也显示了许多蝗虫在交配时不会关心对方是雌性还是雄性，雄性果蝇之间也常常有互相求爱的行为。但是也有人反驳“存在同性基因”这种观念，比如新闻工作者Chandler Burr，他坚持认为只有智人（下有解释）有所谓的性倾向，就像只有人类才会有幽默感一样。